מחקר חדש ממקם את בית המקדש בדרום הר הבית
מחקר שדווח לאחרונה טוען כי בית המקדש עמד בחלקו הדרומי של הר הבית בירושלים, הרחק מהמקום המזוהה בדרך כלל עם כיפת הסלע. התזה בדבר המיקום הדרומי מסתמכת על פערים בין ממדי המתחם כיום לבין התיאורים במשנה ובכתבי יוסף בן מתתיהו, וכן על רמזים אדריכליים וטופוגרפיים. חוקרים אחרים ממקמים את המקדש מעל כיפת הסלע או מצפון-מערב לה, ולכן המיקום המדויק נותר שנוי במחלוקת. חפירה ישירה בהר עדיין אינה מתאפשרת, והחוקרים נאלצים להשוות בין טקסטים עתיקים, חומות ששרדו, חללים תת-קרקעיים ועדויות אדריכליות מתקופות מאוחרות יותר.